Согласно второму постулату Бора (2), при переходе атома водорода из стационарного состояния п в стационарное состояние m с меньшей энергией испускается фотон, энергия которого [с учетом (6)]
откуда частота излучения
где 
— величина, совпадающая с постоянной Ридберга в эмпирических
формулах для атома водорода.
На рис. 2.3 стрелками показаны переходы, приводящие к излучению линий, принадлежащих различным сериям спектра излучения атома водорода.
Спектр поглощения атома водорода также является линейчатым, однако при нормальных условиях он содержит только одну серию — серию Лаймана. Это объясняется тем, что при относительно небольших температуре и давлении атомы водорода не возбуждены и поглощение будет происходить только с первого энергетического уровня, при этом наблюдаются лишь переходы аз основного состояния в возбужденные, т. е. возникает серия Лаймана.
Теория Бора, однако, обладает внутренними противоречиями: с одной стороны, применяет законы классической физики а с другой — основывается на квантовых постулатах. Блестяще объяснив спектр и предсказав правильные значения частот спектральных линий атома водорода, она не смогла объяснить их интенсивности и ответить на вопрос, почему совершаются те или иные переходы. Теория Бора не рассматривала вопросы поляризации, когерентности и т. д. Попытка построить в рамках теории Бора теорию атома гелия — одного из простейших атомов, непосредственно следующего за атомом водорода,— также оказалась неудачной.